Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
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