Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD4L6Q3SYB3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms