Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms