Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms