Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
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PTPRNQ16849 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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PTPRNQ16849 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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PTPRNQ16849 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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PTPRNQ16849 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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PTPRNQ16849 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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PTPRNQ16849 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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PTPRNQ16849 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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PTPRNQ16849 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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PTPRNQ16849 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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PTPRNQ16849 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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PTPRNQ16849 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRNQ16849 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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