Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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RTN1Q16799 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RTN1Q16799 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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