Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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