Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms