Protein–RNA interactions for Protein: Q16401

PSMD5, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD5Q16401 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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PSMD5Q16401 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMD5Q16401 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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