Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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