Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIP4Q15650 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms