Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms