Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF1AQ15573 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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