Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 SLC44A3-AS1-209ENST00000442418 748 ntTSL 514.96□□□□□ -0.011e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 SLC44A3-AS1-202ENST00000418366 893 ntTSL 514.59□□□□□ -0.071e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 SLC44A3-AS1-203ENST00000421997 709 ntTSL 314.59□□□□□ -0.071e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 SCYL2-204ENST00000548392 790 ntTSL 414.42□□□□□ -0.13e-21■■■■■ 27
PCBP2Q15366 SGSM2-213ENST00000574857 3885 ntTSL 214.2□□□□□ -0.141e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.161e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 QDPR-204ENST00000505710 1068 ntTSL 314.06□□□□□ -0.161e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 TRAPPC6B-206ENST00000556765 664 ntTSL 313.88□□□□□ -0.191e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.29e-28■■■■■ 27
PCBP2Q15366 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.29e-28■■■■■ 27
PCBP2Q15366 POM121C-207ENST00000614583 4073 ntTSL 213.76□□□□□ -0.212e-14■■■■■ 27
PCBP2Q15366 SLC44A3-AS1-219ENST00000635440 3323 ntTSL 513.75□□□□□ -0.211e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.231e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.251e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 TRAPPC6B-207ENST00000557764 870 ntTSL 213.51□□□□□ -0.251e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 SLC44A3-AS1-210ENST00000452922 1331 ntTSL 1 (best)13.47□□□□□ -0.251e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 SCYL2-207ENST00000549687 2328 ntTSL 213.46□□□□□ -0.263e-21■■■■■ 27
PCBP2Q15366 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.31e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 SLC44A3-AS1-215ENST00000634870 5956 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.341e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.341e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 ZNF33B-203ENST00000465206 707 ntTSL 312.84□□□□□ -0.351e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.371e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 SHC1-210ENST00000448116 3481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.381e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 SHC1-203ENST00000368449 2879 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.441e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 SLC44A3-AS1-217ENST00000635184 2404 ntTSL 512.25□□□□□ -0.451e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 SLC44A3-AS1-213ENST00000634339 2415 ntTSL 512.18□□□□□ -0.461e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 RWDD2B-206ENST00000486719 1789 ntTSL 512.08□□□□□ -0.481e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 TRAPPC6B-205ENST00000555269 1000 ntTSL 1 (best)11.7□□□□□ -0.541e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 SGSM2-214ENST00000575367 1437 ntTSL 411.68□□□□□ -0.541e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 SCYL2-208ENST00000550067 557 ntTSL 411.12□□□□□ -0.633e-21■■■■■ 27
PCBP2Q15366 SGSM2-211ENST00000574563 3410 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.641e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 TRAPPC6B-204ENST00000554018 541 ntTSL 411.03□□□□□ -0.641e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 GMDS-AS1-214ENST00000534468 724 ntTSL 311.02□□□□□ -0.651e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 ZNF33B-205ENST00000486187 1941 ntTSL 210.86□□□□□ -0.671e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 TRAPPC6B-202ENST00000347691 3229 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.811e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 SLC44A3-AS1-218ENST00000635408 2982 ntTSL 59.87□□□□□ -0.831e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 LARP4-208ENST00000520064 2068 ntTSL 59.71□□□□□ -0.861e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.861e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 MALT1-205ENST00000591792 565 ntTSL 49.6□□□□□ -0.871e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 GPATCH8-202ENST00000585614 686 ntTSL 39.37□□□□□ -0.911e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 ACAP2-215ENST00000618471 3207 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.931e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 LARP4-209ENST00000521120 987 ntTSL 28.94□□□□□ -0.981e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 SCYL2-211ENST00000635101 3948 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.053e-21■■■■■ 27
PCBP2Q15366 MAPK1IP1L-203ENST00000554364 565 ntTSL 28.39□□□□□ -1.078e-39■■■■■ 27
PCBP2Q15366 AC087482.1-203ENST00000560662 331 ntTSL 38.19□□□□□ -1.12e-14■■■■■ 27
PCBP2Q15366 TRAPPC6B-203ENST00000469361 4533 ntTSL 28.08□□□□□ -1.121e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 ACAP2-216ENST00000635383 1647 ntTSL 57.45□□□□□ -1.221e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 NUTM2B-AS1-209ENST00000596088 366 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.241e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 AC087482.1-201ENST00000558097 540 ntTSL 47.02□□□□□ -1.292e-14■■■■■ 27
PCBP2Q15366 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.381e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 GPATCH8-207ENST00000590041 829 ntTSL 56.35□□□□□ -1.391e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 RWDD2B-201ENST00000286777 1625 ntTSL 26.14□□□□□ -1.431e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.442e-14■■■■■ 27
PCBP2Q15366 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.471e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.471e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 NUTM2B-AS1-210ENST00000600376 510 ntTSL 35.84□□□□□ -1.471e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 CNOT4-209ENST00000473470 707 ntTSL 25.81□□□□□ -1.481e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.551e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 RWDD2B-204ENST00000472184 1787 ntTSL 35.09□□□□□ -1.61e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.61e-8■■■■■ 27
PCBP2Q15366 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.681e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.681e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.681e-13■■■■■ 27
PCBP2Q15366 SLC44A3-AS1-207ENST00000432162 646 ntTSL 24.11□□□□□ -1.751e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.772e-14■■■■■ 27
PCBP2Q15366 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.141e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 SIRT5-204ENST00000397350 4382 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.61e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 SIRT5-202ENST00000379250 3727 ntTSL 1 (best)9.05□□□□□ -0.961e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 SIRT5-205ENST00000606117 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.971e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 SIRT5-201ENST00000359782 3797 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.991e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 BGN-204ENST00000480756 2278 ntTSL 513.87□□□□□ -0.193e-6■■■■■ 27
PCBP2Q15366 BGN-203ENST00000472615 2225 ntTSL 512.48□□□□□ -0.413e-6■■■■■ 27
PCBP2Q15366 BGN-201ENST00000331595 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.463e-6■■■■■ 27
PCBP2Q15366 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.44e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 RASGRF2-205ENST00000514946 548 ntTSL 510.14□□□□□ -0.794e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 TRAF7-206ENST00000569686 586 ntTSL 224.55■■□□□ 1.524e-6■■■■■ 27
PCBP2Q15366 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.954e-6■■■■■ 27
PCBP2Q15366 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.234e-6■■■■■ 27
PCBP2Q15366 TRAF7-202ENST00000564067 874 ntTSL 316.49■□□□□ 0.234e-6■■■■■ 27
PCBP2Q15366 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.873e-6■■■■■ 27
PCBP2Q15366 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.52■□□□□ 0.43e-6■■■■■ 27
PCBP2Q15366 PIP5K1C-206ENST00000592530 456 ntTSL 514.65□□□□□ -0.062e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.21e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 XPR1-202ENST00000367590 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.761e-7■■■■■ 27
PCBP2Q15366 WASF2-202ENST00000618852 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.453e-7■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 RAI1-203ENST00000471135 570 ntTSL 312.26□□□□□ -0.452e-6■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.724e-6■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.114e-6■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 MGST3-201ENST00000367883 706 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.574e-6■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 MGST3-204ENST00000367888 778 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.664e-6■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 MGST3-214ENST00000627653 1130 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.664e-6■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 MGST3-212ENST00000495447 720 ntTSL 310.12□□□□□ -0.794e-6■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 MGST3-202ENST00000367884 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.194e-6■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 MGST3-207ENST00000461308 1002 ntTSL 1 (best)7.01□□□□□ -1.294e-6■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.444e-6■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 PGAP1-211ENST00000485830 1222 ntTSL 1 (best)5.65□□□□□ -1.54e-6■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 MGST3-210ENST00000488688 741 ntTSL 24.61□□□□□ -1.674e-6■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.261e-6■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.191e-6■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.231e-6■■■■■ 26.9
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