Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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PRKD1Q15139 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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PRKD1Q15139 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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PRKD1Q15139 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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PRKD1Q15139 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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PRKD1Q15139 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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PRKD1Q15139 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRKD1Q15139 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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