Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERC3Q15034 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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