Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
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CHD4Q14839 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
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CHD4Q14839 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
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CHD4Q14839 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
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CHD4Q14839 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
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CHD4Q14839 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
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CHD4Q14839 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
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CHD4Q14839 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
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