Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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