Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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