Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
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COL4A6Q14031 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
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COL4A6Q14031 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
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COL4A6Q14031 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
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COL4A6Q14031 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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