Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CNGB1Q14028 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
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