Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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