Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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PDE6HQ13956 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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PDE6HQ13956 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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PDE6HQ13956 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6HQ13956 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
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