Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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