Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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ITGA9Q13797 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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ITGA9Q13797 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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