Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOFQ13790 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOFQ13790 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOFQ13790 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOFQ13790 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOFQ13790 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOFQ13790 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOFQ13790 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOFQ13790 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOFQ13790 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOFQ13790 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
APOFQ13790 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
APOFQ13790 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOFQ13790 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOFQ13790 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOFQ13790 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOFQ13790 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
APOFQ13790 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOFQ13790 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOFQ13790 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
APOFQ13790 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOFQ13790 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOFQ13790 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOFQ13790 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOFQ13790 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOFQ13790 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOFQ13790 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOFQ13790 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
APOFQ13790 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOFQ13790 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOFQ13790 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOFQ13790 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOFQ13790 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOFQ13790 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOFQ13790 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOFQ13790 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOFQ13790 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOFQ13790 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOFQ13790 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOFQ13790 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOFQ13790 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
APOFQ13790 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOFQ13790 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOFQ13790 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOFQ13790 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOFQ13790 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOFQ13790 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOFQ13790 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOFQ13790 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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APOFQ13790 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOFQ13790 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOFQ13790 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOFQ13790 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOFQ13790 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOFQ13790 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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APOFQ13790 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOFQ13790 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOFQ13790 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOFQ13790 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOFQ13790 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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APOFQ13790 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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APOFQ13790 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOFQ13790 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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APOFQ13790 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOFQ13790 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
APOFQ13790 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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APOFQ13790 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOFQ13790 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOFQ13790 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOFQ13790 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
APOFQ13790 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOFQ13790 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOFQ13790 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOFQ13790 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOFQ13790 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOFQ13790 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOFQ13790 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
APOFQ13790 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOFQ13790 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOFQ13790 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOFQ13790 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOFQ13790 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOFQ13790 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOFQ13790 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOFQ13790 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
APOFQ13790 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOFQ13790 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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