Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
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