Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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