Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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