Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PKD2Q13563 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
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