Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATRQ13535 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATRQ13535 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATRQ13535 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATRQ13535 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATRQ13535 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATRQ13535 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
ATRQ13535 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATRQ13535 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATRQ13535 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATRQ13535 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATRQ13535 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATRQ13535 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATRQ13535 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATRQ13535 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATRQ13535 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATRQ13535 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATRQ13535 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATRQ13535 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATRQ13535 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATRQ13535 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATRQ13535 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATRQ13535 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATRQ13535 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATRQ13535 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
ATRQ13535 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATRQ13535 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATRQ13535 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATRQ13535 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATRQ13535 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATRQ13535 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATRQ13535 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATRQ13535 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATRQ13535 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATRQ13535 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATRQ13535 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATRQ13535 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATRQ13535 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATRQ13535 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATRQ13535 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATRQ13535 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATRQ13535 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATRQ13535 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATRQ13535 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATRQ13535 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATRQ13535 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATRQ13535 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATRQ13535 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATRQ13535 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATRQ13535 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
ATRQ13535 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATRQ13535 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATRQ13535 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATRQ13535 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATRQ13535 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATRQ13535 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATRQ13535 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
ATRQ13535 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATRQ13535 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
ATRQ13535 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATRQ13535 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATRQ13535 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATRQ13535 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATRQ13535 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
ATRQ13535 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATRQ13535 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATRQ13535 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATRQ13535 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATRQ13535 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATRQ13535 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATRQ13535 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATRQ13535 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATRQ13535 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATRQ13535 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATRQ13535 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATRQ13535 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATRQ13535 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATRQ13535 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATRQ13535 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATRQ13535 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
ATRQ13535 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATRQ13535 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATRQ13535 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATRQ13535 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
ATRQ13535 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
ATRQ13535 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATRQ13535 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATRQ13535 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATRQ13535 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
ATRQ13535 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
ATRQ13535 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.11
ATRQ13535 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATRQ13535 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ATRQ13535 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATRQ13535 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATRQ13535 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATRQ13535 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATRQ13535 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATRQ13535 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATRQ13535 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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