Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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