Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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ERCC8Q13216 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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ERCC8Q13216 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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ERCC8Q13216 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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ERCC8Q13216 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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ERCC8Q13216 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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ERCC8Q13216 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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