Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.42e-7■■■□□ 17.4
TARDBPQ13148 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.32e-7■■■□□ 17.4
TARDBPQ13148 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.012e-7■■■□□ 17.4
TARDBPQ13148 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.223e-6■■■□□ 17.4
TARDBPQ13148 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.432e-14■■■□□ 17.3
TARDBPQ13148 MSL1-207ENST00000580086 2638 ntTSL 27.96□□□□□ -1.142e-14■■■□□ 17.3
TARDBPQ13148 MSL1-201ENST00000339569 3424 ntTSL 24.61□□□□□ -1.672e-14■■■□□ 17.3
TARDBPQ13148 CTBP2-206ENST00000460976 603 ntTSL 526.63■■□□□ 1.852e-7■■■□□ 17.3
TARDBPQ13148 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.212e-7■■■□□ 17.3
TARDBPQ13148 CTBP2-208ENST00000476817 705 ntTSL 321.04■□□□□ 0.962e-7■■■□□ 17.3
TARDBPQ13148 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.532e-7■■■□□ 17.3
TARDBPQ13148 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.422e-7■■■□□ 17.3
TARDBPQ13148 CTBP2-212ENST00000530884 578 ntTSL 311.22□□□□□ -0.612e-7■■■□□ 17.3
TARDBPQ13148 CTBP2-203ENST00000337195 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.762e-7■■■□□ 17.3
TARDBPQ13148 NFATC3-209ENST00000561714 792 ntTSL 323.64■■□□□ 1.374e-8■■■□□ 17.3
TARDBPQ13148 NFATC3-219ENST00000568466 737 ntTSL 221.8■■□□□ 1.084e-8■■■□□ 17.3
TARDBPQ13148 NFATC3-210ENST00000562171 707 ntTSL 321.14■□□□□ 0.974e-8■■■□□ 17.3
TARDBPQ13148 NFATC3-206ENST00000539828 2484 ntTSL 216.1■□□□□ 0.174e-8■■■□□ 17.3
TARDBPQ13148 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.074e-8■■■□□ 17.3
TARDBPQ13148 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.194e-8■■■□□ 17.3
TARDBPQ13148 NFATC3-217ENST00000566893 715 ntTSL 211.72□□□□□ -0.534e-8■■■□□ 17.3
TARDBPQ13148 NFATC3-204ENST00000379165 3583 ntTSL 210.25□□□□□ -0.774e-8■■■□□ 17.3
TARDBPQ13148 NFATC3-213ENST00000563319 4122 ntTSL 1 (best)9.66□□□□□ -0.864e-8■■■□□ 17.3
TARDBPQ13148 NFATC3-208ENST00000553077 3870 ntTSL 28.91□□□□□ -0.984e-8■■■□□ 17.3
TARDBPQ13148 NFATC3-220ENST00000569766 3555 ntTSL 1 (best)7.58□□□□□ -1.24e-8■■■□□ 17.3
TARDBPQ13148 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.284e-8■■■□□ 17.3
TARDBPQ13148 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.314e-8■■■□□ 17.3
TARDBPQ13148 NFATC3-207ENST00000549350 3588 ntTSL 26.85□□□□□ -1.314e-8■■■□□ 17.3
TARDBPQ13148 NFATC3-211ENST00000562926 3748 ntTSL 1 (best)6.51□□□□□ -1.374e-8■■■□□ 17.3
TARDBPQ13148 NFATC3-216ENST00000566301 3840 ntTSL 1 (best)6.28□□□□□ -1.44e-8■■■□□ 17.3
TARDBPQ13148 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.484e-8■■■□□ 17.3
TARDBPQ13148 NFATC3-221ENST00000570212 3181 ntTSL 1 (best)5.75□□□□□ -1.494e-8■■■□□ 17.3
TARDBPQ13148 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.051e-6■■■□□ 17.3
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TARDBPQ13148 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.726e-10■■■□□ 17.3
TARDBPQ13148 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.346e-10■■■□□ 17.3
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TARDBPQ13148 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.016e-10■■■□□ 17.3
TARDBPQ13148 TMEM263-202ENST00000547081 833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.616e-10■■■□□ 17.3
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TARDBPQ13148 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.56e-10■■■□□ 17.3
TARDBPQ13148 TYK2-204ENST00000525220 583 ntTSL 417.16■□□□□ 0.341e-6■■■□□ 17.3
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TARDBPQ13148 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.31e-6■■■□□ 17.3
TARDBPQ13148 TYK2-202ENST00000524462 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.61e-6■■■□□ 17.3
TARDBPQ13148 TYK2-201ENST00000264818 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.611e-6■■■□□ 17.3
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TARDBPQ13148 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.793e-8■■■□□ 17.3
TARDBPQ13148 D2HGDH-206ENST00000436747 4549 ntTSL 1 (best)16.66■□□□□ 0.263e-8■■■□□ 17.3
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TARDBPQ13148 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.833e-6■■■□□ 17.3
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TARDBPQ13148 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.925e-7■■■□□ 17.3
TARDBPQ13148 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.045e-7■■■□□ 17.3
TARDBPQ13148 FADS3-212ENST00000534223 800 ntTSL 513.72□□□□□ -0.215e-7■■■□□ 17.3
TARDBPQ13148 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.312e-8■■■□□ 17.3
TARDBPQ13148 SH2B1-209ENST00000563674 719 ntTSL 323.12■■□□□ 1.292e-6■■■□□ 17.3
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TARDBPQ13148 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.852e-6■■■□□ 17.3
TARDBPQ13148 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.562e-6■■■□□ 17.3
TARDBPQ13148 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.292e-6■■■□□ 17.3
TARDBPQ13148 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.112e-6■■■□□ 17.3
TARDBPQ13148 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.12e-6■■■□□ 17.3
TARDBPQ13148 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.042e-6■■■□□ 17.3
TARDBPQ13148 SH2B1-214ENST00000569471 791 ntTSL 314.08□□□□□ -0.162e-6■■■□□ 17.3
TARDBPQ13148 SH2B1-207ENST00000561629 613 ntTSL 210.15□□□□□ -0.782e-6■■■□□ 17.3
TARDBPQ13148 SH2B1-210ENST00000566176 546 ntTSL 49.38□□□□□ -0.912e-6■■■□□ 17.3
TARDBPQ13148 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.291e-8■■■□□ 17.2
TARDBPQ13148 AC017083.4-201ENST00000406334 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.611e-8■■■□□ 17.2
TARDBPQ13148 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.561e-8■■■□□ 17.2
TARDBPQ13148 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.781e-8■■■□□ 17.2
TARDBPQ13148 MYO18A-207ENST00000530254 6479 ntTSL 1 (best)12.97□□□□□ -0.332e-8■■■□□ 17.2
TARDBPQ13148 MSI2-213ENST00000581523 534 ntTSL 24.92□□□□□ -1.629e-7■■■□□ 17.2
TARDBPQ13148 MSI2-211ENST00000579531 472 ntTSL 24.75□□□□□ -1.659e-7■■■□□ 17.2
TARDBPQ13148 C7orf50-204ENST00000412051 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 222.14■■□□□ 1.132e-8■■■□□ 17.2
TARDBPQ13148 C7orf50-205ENST00000444428 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 315.5■□□□□ 0.072e-8■■■□□ 17.2
TARDBPQ13148 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.241e-6■■■□□ 17.2
TARDBPQ13148 ATL2-203ENST00000405384 1905 ntTSL 1 (best)12.96□□□□□ -0.331e-6■■■□□ 17.2
TARDBPQ13148 ATL2-201ENST00000378954 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.41e-6■■■□□ 17.2
TARDBPQ13148 ATL2-204ENST00000406122 2864 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.511e-6■■■□□ 17.2
TARDBPQ13148 ATL2-206ENST00000419554 2335 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.511e-6■■■□□ 17.2
TARDBPQ13148 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.631e-6■■■□□ 17.2
TARDBPQ13148 SND1-206ENST00000468166 552 ntTSL 47.36□□□□□ -1.239e-7■■■□□ 17.2
TARDBPQ13148 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.622e-6■■■□□ 17.2
TARDBPQ13148 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.452e-6■■■□□ 17.2
TARDBPQ13148 NDUFA10-207ENST00000443626 776 ntTSL 513.71□□□□□ -0.212e-6■■■□□ 17.2
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