Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms