Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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