Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMARCB1Q12824 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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