Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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FOXO1Q12778 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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FOXO1Q12778 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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