Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
HMGXB3Q12766 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
HMGXB3Q12766 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
HMGXB3Q12766 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
HMGXB3Q12766 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
HMGXB3Q12766 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
HMGXB3Q12766 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC32.26■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC32.26■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC32.25■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC32.24■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC32.24■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC32.23■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC32.23■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
HMGXB3Q12766 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.74
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