Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms