Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms