Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms