Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms