Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOS1Q07889 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOS1Q07889 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOS1Q07889 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOS1Q07889 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOS1Q07889 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOS1Q07889 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOS1Q07889 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOS1Q07889 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOS1Q07889 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOS1Q07889 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOS1Q07889 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOS1Q07889 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOS1Q07889 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOS1Q07889 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOS1Q07889 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOS1Q07889 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SOS1Q07889 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOS1Q07889 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SOS1Q07889 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOS1Q07889 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOS1Q07889 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOS1Q07889 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOS1Q07889 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOS1Q07889 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOS1Q07889 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOS1Q07889 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOS1Q07889 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOS1Q07889 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOS1Q07889 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SOS1Q07889 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SOS1Q07889 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SOS1Q07889 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SOS1Q07889 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SOS1Q07889 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SOS1Q07889 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SOS1Q07889 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SOS1Q07889 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SOS1Q07889 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SOS1Q07889 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SOS1Q07889 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SOS1Q07889 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SOS1Q07889 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SOS1Q07889 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SOS1Q07889 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOS1Q07889 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms