Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLEQ07864 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLEQ07864 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLEQ07864 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLEQ07864 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLEQ07864 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLEQ07864 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
POLEQ07864 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
POLEQ07864 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLEQ07864 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
POLEQ07864 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLEQ07864 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLEQ07864 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLEQ07864 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLEQ07864 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLEQ07864 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLEQ07864 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLEQ07864 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLEQ07864 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLEQ07864 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLEQ07864 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLEQ07864 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLEQ07864 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLEQ07864 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLEQ07864 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLEQ07864 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLEQ07864 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLEQ07864 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLEQ07864 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLEQ07864 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLEQ07864 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLEQ07864 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLEQ07864 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLEQ07864 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLEQ07864 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
POLEQ07864 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLEQ07864 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLEQ07864 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLEQ07864 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLEQ07864 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
POLEQ07864 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLEQ07864 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
POLEQ07864 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLEQ07864 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLEQ07864 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLEQ07864 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLEQ07864 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLEQ07864 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLEQ07864 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLEQ07864 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLEQ07864 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLEQ07864 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLEQ07864 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLEQ07864 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLEQ07864 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLEQ07864 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLEQ07864 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLEQ07864 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLEQ07864 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLEQ07864 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLEQ07864 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLEQ07864 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLEQ07864 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLEQ07864 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLEQ07864 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLEQ07864 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLEQ07864 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLEQ07864 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLEQ07864 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLEQ07864 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLEQ07864 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLEQ07864 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLEQ07864 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLEQ07864 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLEQ07864 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLEQ07864 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLEQ07864 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLEQ07864 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLEQ07864 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
POLEQ07864 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLEQ07864 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLEQ07864 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLEQ07864 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLEQ07864 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLEQ07864 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLEQ07864 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLEQ07864 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
POLEQ07864 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLEQ07864 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLEQ07864 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLEQ07864 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLEQ07864 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLEQ07864 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLEQ07864 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
POLEQ07864 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLEQ07864 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLEQ07864 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLEQ07864 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLEQ07864 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLEQ07864 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms