Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms