Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK18Q07002 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CDK18Q07002 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CDK18Q07002 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms