Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms