Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms