Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNEQ04844 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms